

Lors de la seconde guerre du Haut-Karabagh en octobre 2020 , une polémique naît dans la presse [ 17 ] , [ 18 ] et sur les réseaux sociaux [ 19 ] . Alain Houpert est président du groupe d'amitié France-Azerbaïdjan au Sénat [ 20 ] . Il est également membre de l'Association des amis de l'Azerbaïdjan, accusée d'être un outil d'influence au service du régime autoritaire azerbaïdjanais [ 21 ] , qui a déclenché la guerre par son offensive militaire sur le Haut-Karabagh [ 20 ] . Il est de plus soupçonné d'être impliqué dans le système de la « diplomatie du caviar » mise en place par le régime azerbaïdjanais [ 22 ] , [ 23 ] .
Lors de la crise de la Covid-19 en 2020, Alain Houpert prend fréquemment la parole au Sénat et dans les médias pour défendre la liberté de prescription de l' hydroxychloroquine pour protester contre la gestion sanitaire [ 10 ] , [ 11 ] . Il apparaît en outre dans le documentaire Hold-up et critique la campagne de vaccination contre le Covid-19 . En mars 2020 , il s'oppose à une dérogation permettant aux médecins de ville de prescrire librement du Rivotril , hors autorisation de mise sur le marché [ 12 ] .